Voda-voda
Zdrojem vytápění i ohřevu vody může být tepelné čerpadlo voda-voda. Princip získávání tepelné energie je podobný jako u tepelného čerpadla vzduch-voda, ale jen s tím rozdílem, že zdrojem tepla je podzemní či povrchová voda. Z tohoto zdroje je čerpáno použitelné teplo a předáváno otopnému systému v domě. K fungování celého systému, pohonu čerpadla a kompresoru je nutná elektrická energie. Její spotřeba je však velmi nízká a teplo je zdarma. Tepelná čerpadla voda-voda potřebují ke svému provozu dostatečný zdroj podzemní vody, respektive vydatnost pramene, nebo povrchovou vodu v blízkosti.
Tato čerpadla fungují jako otevřený systém
Tepelná čerpadla voda-voda, která využívají podzemní vodu, fungují jako otevřený systém. Prostřednictvím potrubí se odebírá voda ze studny o stálé teplotě, toto teplo odevzdá chladivu ve výparníku, a chladná voda se vypouští do tzv. vsakovací studny. Ve výparníku se ohřáté chladivo změní na plyn, v kompresoru se prudce stlačí, takže se jeho teplota výrazně zvýší, a předá teplo otopnému systému.
Chladivo, které odevzdalo teplo, se vrací do výměníku, kde se setkává s teplejší vodou ze studny. Tato tepelná čerpadla potřebují, aby zdroj v první studně byl dostatečný a v druhé studni bylo podloží s dobrými vsakovacími podmínkami.
Náklady jsou však vyšší než u čerpadla vzduch-voda
Výhodou tepelného čerpadla voda-voda je, že teplota vody ve studni je po celý rok konstantní nebo má minimální výkyvy. Také investiční náklady oproti tepelnému čerpadlu země-voda jsou nižší. Naopak tepelná čerpadla vzduch-voda jsou podstatně levnější než při použití vody jako zdroje tepelné energie. Protože jde o otevřený systém, u některých typů čerpadel voda-voda je nutná údržba potrubí a filtrů, které jsou umístěny ve studni. Druhá varianta, tedy použití povrchového zdroje, není tak častá, protože vyžaduje povolení správce vodního zdroje. Výhodná je například pro obecní úřad, který vlastní rybník.